各文明都拥有着一致的科文树，因此不论微操上怎样变化，游戏的大流程是不会变的。为了描述起来方便，将科文树上的壹个个节点称为豆腐块，每壹个豆腐块的解开都需要相应的科文值。在游戏左上方显示了帝国每回合获取的科文值，鼠标放上去可显示细分的条目。当锁定壹个豆腐块后，每回合都会获取帝国提供的科文。当科文装满的那回合，该豆腐块并解开了科技数。总共有七十七个豆腐块，文化树则拥有六十壹个豆腐块。科技树和市政数虽然都是靠科文值的获取来解开豆腐块，看上去似乎每个都是一样，但实际不同差异还是很大的。

科技树将七十七个豆腐块以列的形式排列，每一列拥有八个豆腐块槽位。当一些科技处于同一列时，其解开所需要的科技值便是相同的。科技数大致可分为上下两层科技线，一至四行，上层的豆腐块主要偏给于海军及其帝国的进步，四到八行下层科技线主要偏给于陆军及战争。但这并不是完全的，比如种田给第一的奇观基瓦便处于下层的第八行在科技树中，自火箭研究之后的某些科技是无法通过做任务获取尤里卡的，这些科技只能通过激活伟人奇观或间谍获取。最后两列是隐藏科技，这些隐藏科技是固定位置的。将这些前置科技解开后，隐藏科技便会显示了市政数。

不同于科技树，每一列比科技树少一行，整条市政线并不像科技线那样被分成上下两层，而是被分为了主线和支线。主线的豆腐块在当中，支线分布于两侧。即使两个豆腐块同处一列，主线和支线所需要的文化值也是不同的。比如拿古典时期防御战略这一列举例，由于防御战略和历史记录都属于主线，不需二百一十点文化值接送。军事训练和神学则属于是支线，所需的文化值就只需要一百四十四点了。

只有主线的市政才会解开总督槽位，支线市政则会获取大量的使者。文艺复兴时期一个相对奇妙的时代，在这段时期里，无法从市政当中获取任何的总督和使者。因此当市政进入文艺复兴时期时，对城邦的掌控就会处于壹个疲软期。最好留一两个使者或者文化树，有一些备用的获取使者的市政，以防止城邦脱空。